Entre os aquários urbanos de Tóquio, o Sumida Aquarium se destaca pelo formato compacto de visita autoguiada dentro do Tokyo Skytree Town e por uma duração de visita de cerca de 1,5 a 3 horas. Inaugurado em 2012, o local tem como destaque os ambientes marinhos locais no tanque Tokyo Dai-Suiso, oferece observação a céu aberto de pinguins e focas-de-pêlo e mantém a experiência totalmente acessível e em ambiente fechado.

Inaugurado em 2004, o Aquário de Enoshima mostra como um aquário costeiro pode ser construído em torno de um ambiente marinho específico. Seus tanques na Baía de Sagami, as exposições de águas profundas ligadas à Fossa de Sagami, que fica bem perto, e as exibições de águas-vivas, que contam com o apoio de colaborações de pesquisa, dão ao local um foco regional e científico mais forte do que a programação padrão de peixes e espetáculos que os visitantes costumam ver hoje em dia.

O Sunshine Aquarium ajuda a definir o conceito de aquário urbano em Tóquio: foi inaugurado em 1978, passou por uma grande reforma em 2011 e hoje exibe cerca de 10.000 animais em um espaço compacto na cobertura do Sunshine City. As exposições internas de recifes, águas-vivas e rios levam ao Jardim Marinho ao ar livre, mostrando como um aquário no centro da cidade pode se encaixar em um roteiro curto por Tóquio.